تلبيةً لحاجات الأبناء ذوي الإعاقة القادمين من مناطق نائية تفتقر إلى مدارس دامجة ومؤسّسات متخصّصة، ولا سكن لهم في بيروت وضواحيها، يُقدّم القسم الرّعائيّ خدمة الرّعاية الإنسانيّة المتكاملة لتعليم وتأهيل الأبناء، وتحقيق استقلاليّتهم الحياتيّة وتمكينهم من الاندماج الاجتماعيّ.

يعتمد القسم الرّعائي نظام الأُسَر، ويُطبّق برامج تربويّة متنوّعة تُلبّي احتياجاتهم؛ ويتابع كلّ مجموعة من الأبناء مُشرف رعائيّ يُقدّم لهم الخدمات التّربويّة، الرّعائيّة، التّعليميّة والحياتيّة، وذلك من خلال:

- قسم الصّحّة المدرسيّة

- الإرشاد الدّينيّ

- الإرشاد التّربويّ والنّفسيّ

- الأنشطة الرّعائيّة، الأندية والفوج الكشفيّ

- قسم التّغذية والخدمات الحياتيّة

يضمّ هذا القسم ممرّضًا مُجازًا وفريقًا طبيًّا متخصّصًا: طبيب صحّة عامّة، عيون، أذن أنف حنجرة، وطبيب قلب؛ ويقدّم خدمات علاجيّة ووقائيّة للطّلّاب والعاملين، من خلال معاينات طبّيّة دوريّة، كما يتولّى التّنسيق والتّعاون المستمرّ مع وزارتَي "التّربية" وّالصّحّة" والجامعات التي تُعنى بالاختصاصات الطّبّية والعلاجيّة، والمنظّمات المحلّيّة والدّوليّة.

يُشرف قسم الصّحّة على:

- الرّصد الوبائيّ المُستمرّ واللّقاحات الإلزاميّة

- الكشف السّريري العامّ

- متابعة الأمراض المزمنة والأدوية وإصدار اللّوائح اللّازمة وتعميمها على نظّار المدارس لمراعاة ما يلزم من احتياجات الأطفال.

- التّدقيق على قسم الخدمات البيئيّة والمطبخ والكافتيريا وفق معايير نظام HACCP لضمان السّلامة وجودة الطّعام.

انطلق العمل بهذا القسم منذ العام 1997، ويعمل على متابعة خرّيجي المؤسّسة ضمن تقنيّة "المرشد الجوّال"، لدمجهم في المدارس الثّانوية والجامعات والمعاهد المهنيّة للتّعليم العاليّ، وتأمين فرص تعليميّة وعمليّة مناسبة، مع متابعة مستمرّة لدعم اندماجهم في سوق العمل.